Yleisimmät haittavaikutukset ovat epänormaalit unet ja unettomuus. Joskus voi myös esiintyä mm. ahdistuneisuutta, masentuneisuutta, huimausta, päänsärkyä, näkökyvyn heikkenimistä, kiertohuimausta, vatsaoireita tai kutinaa.
Jos estolääkityksen aikana ilmenee äkillistä tuskaisuutta, masennusta tai sekavuutta, lääkitys pitää lopettaa ja ottaa yhteys lääkäriin estolääkkeen vaihtamiseksi.
Jos esiintyy neuropaattisia oireita, kuten kipua, kuumotusta, pistelyä, tunnottomuutta ja/tai heikkoutta, on lääkkeen käyttö on lopetettava ja otettava yhteyttä lääkäriin.
Malariatartunnan voi saada estolääkityksestä huolimatta. Lääkäriin on syytä ottaa yhteyttä, jos malaria-alueelta paluun jälkeen ilmaantuu tautiin viittaavia oireita, kuten vilunvärein alkavia muutaman tunnin kestäviä kuumekohtauksia.
Jos lääke aiheuttaa huimausta, väsymystä, vapinaa tai sekavuutta, autolla ajoa pitää välttää.