Kuningas Adolf Fredrik myönsi Turun akatemialle apteekkiprivilegion 24.9.1755. Asiakirja muodosti perustan apteekin oikeudelliselle asemalle.
Virstanpylväät Yliopiston Apteekin historiassa:
- 1640 Turun akatemian perustaminen.
- 1755 (24.9.) Turun akatemia saa apteekkiprivilegion, apteekkarilla velvollisuus opettaa lääketieteen opiskelijoille kemiaa ja lääkeaineiden tuntemusta. 1757 Akatemian apteekki avataan Turkuun. Turun piirilääkäri, tuleva "Suomen lääketieteen isä" Johan Haartman tekee aktiivista yhteistyötä apteekin kanssa. 1783 Haartman käyttää Turun akatemian apteekkarin varoja lääketieteellisen tiedekunnan kehittämiseen.
- 1809 Suomi liitetään Venäjään.
- 1812 John Julin apteekkariksi. Julin aloittaa kiinankuoren jauhamisen ja viennin ulkomaille. Tutustuu Eurooppaan suuntautuneella matkallaan höyryvoimaan ja kone-pajateollisuuteen. Siirtyy lopulta Fiskarsiin ja tunnetaan Suomen konepajateollisuuden uranuurtajana.
- 1827 Turun palo, kaikki kolme apteekkia tuhoutuvat.
- 1828 Akatemia muuttaa Helsinkiin, apteekki akatemian mukana
- 1829 Lääketieteellinen tiedekunta pitää Julinin apteekkia maan parhaana ja apteekki saa yksinoikeuden toimittaa kaikki suunnitteilla olevan kliinisen instituutin (yliopistollinen keskussairaala) lääkkeet.
- 1853 Yliopisto päättää luovuttaa apteekin suurimman vuokratarjouksen tehneelle hakijalle. Yliopisto ja apteekkarit menettävät mielenkiintonsa apteekin kehittämiseen
- 1866-68 Suuret nälkävuodet
- 1872 Yliopiston Apteekin ensimmäinen naisoppilas (Suomen ensimmäinen 1869)
- 1877 Apteekkiin vesijohto
- 1889 Sähkövalo
- 1914 Ensimmäinen maailmansota syttyy, lääketuonti romahtaa, suuri määrä talveksi tilatuista lääkkeistä jää Stettiniin.
- 1917 Suomen itsenäistyminen ja kansalaissota 1918.
- 1919 Kieltolaki, reseptiluku kasvaa kolmessa vuodessa kolminkertaiseksi. Laskee myöhemmin, kun alkoholin saantiehtoja kiristetään
- 1930 Apteekin asiakasmäärät kääntyvät kasvuun, kun apteekkariksi taitava Axel Gahmberg.
- 1936 Apteekkitavaralaki, sairaalat saavat ostaa lääkkeet suoraan tehtaista ja tukku-kaupoista, apteekkien toimitukset vähenevät.
- 1937 Yliopiston Apteekki ensimmäisen kerran Suomen suurin apteekki.
- 1939 Toinen maailmansota, lääkepula.
- 1948 Yliopiston Apteekki pysyvästi Suomen suurin apteekki.
- 1950 Apteekki otetaan yliopiston hoitoon, Viljo Purasmaa apteekkariksi.
- 1952-1953 Lääkevarastojen perustamista koskevan lakiesityksen kiihkeä eduskuntakäsittely, pääministeri Urho Kekkonen runnoo lain läpi. 1953 Apteekki saa oikeuden lääkevarastojen perustamiseen. 1954-1974 Kuusitoista lääkevarastoa (sivuapteekkia) eri puolille Suomea (ensimmäinen Savonlinnaan ja viimeinen Saloon)
- 1980-luku: Tietokoneet tehokkaaseen käyttöön kaikissa työvaiheissa, reseptilääk-keiden suoratoimitus, itsehoitolääkkeet palveluvalintaan.
- 1990-luku: Keskitetty puhelinpalvelu, kanta-asiakasohjelma, pitkät aukioloajat. Esillä yliopistoapteekkilaitoksen lakkauttaminen, joka ei toteutunut, koska poliitikot ja virkamiehet tunnustivat Yliopiston Apteekin ansiot ja saattoivat kavahtaa myös uudistuksen aiheuttamia kustannuksia.
- 1999 Kuopion yliopisto saa omat apteekkioikeudet, Yliopiston Apteekki joutuu luovuttamaan sille Kuopiossa sijainneen sivuapteekin. Korvaava apteekki avataan Helsinkiin Malmille (2001)
- 2000-luku: aktiivinen rooli lääkevaihdossa, lääkkeiden yhteisvaikutusseuranta, pa-nostus henkilökunnan koulutukseen YA-Akatemiassa.
- 2004 kansainvälistyminen alkaa, ensimmäiset YA Ülikooli Apteekit avataan Virossa Viru-keskuksessa Tallinnassa ja Viljandissa.
- 2005 Yliopiston Apteekki juhlii 250-vuotista taivaltaan. Apteekin uusi historiikki: Apteekkareita, lääkkeitä ja professoreita (Jukka Muiluvuori) julkaistaan.
- 2005 apteekkitoiminta aloitetaan Venäjällä.
- 2007 Yliopiston Apteekissa otetaan käyttöön uudenlainen reseptipalvelukaluste, jossa erityistä huomiota on kiinnitetty asiakkaan asiointirauhaan ja intimiteettisuojaan sekä työergonomiaan. Yliopiston Apteekin ensimmäinen ympäristösuunnitelma otetaan käyttöön.
- 2008 Apteekkitoiminnan aloittamista Ruotsissa selvitetään.
- 2009 Viitehintajärjestelmä käyttöön Suomessa.